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CDK
The Chemistry Development Kit
chemtoolkits中分子描述符计算(molecular descriptor calculator)完成      摘要: 参照Rajarshi Guha的CDKDescUI代码,已经把CDK的分子描述符计算(molecular descriptor calculator)集成到chemtoolkits中了,其中包含44个描述符。  阅读全文
posted @ 2011-04-12 22:54 周锐 阅读(1134) | 评论 (0)  编辑
使用rcdk进行化合物结构聚类处理      摘要: rcdk, 是在R下面集成了CDK工具包,以此来通过CDK生成的化学性质数据进行更深层次的统计分析,下面来看看在rcdk中如何进行多个化合物结构的聚类。  阅读全文
posted @ 2011-04-11 21:41 周锐 阅读(869) | 评论 (0)  编辑
chemtoolkits(CTK)部分功能和界面      摘要: Chemtoolkits(CTK)部分功能和界面已经完成,目前网站的主要辅助性的功能已经加入,比如新闻、文章、留言以及其他信息内容。化学信息学方面的目前只整合了里宾斯基五规则计算,以及比较流行的OSIRIS Property Explorer (LogP, 溶解度、成药可能性预测)小工具。  阅读全文
posted @ 2011-04-09 17:16 周锐 阅读(628) | 评论 (0)  编辑