首先说明为什么要在Linux下边开发J2EE。思考了一下大致有以下几点：
1，公司规定，:-)被强迫离开易用的windows了；
2，项目需要。这个因人而异，不好多说。
3，想换个环境。window确实用烦了，可怜的机器整天运行着javaw.exe和eclipse.exe之外，还要加一个甚至好些安全类软件，生怕
病毒或者木马来袭。除此以为，可能还有QQ,MSN，outLook之类的通信软件，这样一来消耗的资源可真就大了，电脑运行的速度可就真不敢恭维了，每
天老牛拉车似的。Linux下边就清爽了许多，无需杀毒软件，至少目前来说安全性不用管那么了，裸奔呗，最多开个防火墙。通信软件有pidgin等这种多
协议的软件，打开一个登陆多个号码，太爽了！呵呵（具体对比还是用了Linux才知道:-)）
4，目前工作前景来看，Linux能带给你的能力比window大多了哦。所以，尽量还是多学点东西吧。
那么究竟怎么配置J2EE开发环境呢？分以下几步：
1，安装JDK；
2，安装eclipse；
3，安装安装Tomcat;
4，安装数据库
（以下均以Ubuntu8.04hardy示例，在Ubuntu8.04下均成功配置，其他版本Linux有少些不同，请注意）
安装JDK：
1，这里示例安装JDK5。打开终端，输入
sudo apt-get install sun-java5-jdk
开始下载sun
jdk1.5之后安装。
2，安装之前会有一个深蓝色背景的sun公司给出的Agreement协议，用Tab键选择Agree(同意)并回车，才开始进入安装。安装需要一小会。
3，安装完成后配置环境变量。
sudo gedit /etc/environment
4，打开环境变量文件，在其中添加以下代码：
CLASSPATH=.:/usr/lib/jvm/java-5-sun/lib
JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-5-sun
注意：其中java-5-sun是jdk所在的文件夹，可能和这不同。请在/usr/lib/jvm/查看您机器上安装的文件夹名。添加完毕无误请保存。
5，打开jvm虚拟机配置文件。
sudo gedit /etc/jvm
添加以下代码到最上方：
/usr/lib/jvm/java-5-sun
注意java-5-sun还是你机器上jdk所在文件夹名。
6，打开终端，输入java 或 javac进行测试，是否安装成功。查看jdk版本号用javac
-version。
安装eclipse：
网上有很多eclipse的安装方法，一般都是直接在源里安装再添加插件的，本人觉得那样太麻烦，费时间！推荐一个最简单的办法，那就是下载一个完全集成web开发插件的eclipse版本。
点击这里进入下载地址。这可是大名鼎鼎的Lomboz直接集成所有web开发插件的eclipse哦。下载界面版本任选，但是一定要下载Linux
(x86/GTK 2)平台的安装包!如果是要使用tomcat6及以上版本，请选择3.2以上版本下载，3.2以下版本不支持。
下载好的包比方说是org.objectweb.lomboz-all-in-one-R-3.3-200710290621-linux-gtk.tar.gz。直接解压到home/你的用户名
目录下即可运行eclipse。
打开eclipse后，点击window->perferences->Java->Buile
path,选中folders；再->Compiles,确认Compiler compliance
level后边是5.0.（如果你想用jdk1.5来运行eclipse的话）（因为运行java时默认的1.4和5.0还是有差别的）。再
->Installed
JRES，这里可以看到你机器上装的JDK.如果是Fedora,可能装了其他的JDK,在这里可以去掉前边的勾，不选择它。
eclipse
jdk配置完成。
安装tomcat：
1,首先，不建议从源里安装。源里的不是整个tomcat,单纯
sudo apt-get install tomcat
默认是没有webApps的。tomcat即使运行了也不会显示http://localhost:8180那个页面。需要再附加。所以还不如直接下载tomcat。
这里安装tomcat5.5。
下载地址：http://tomcat.apache.org/
2,下载完成后，将包解压至home/你的用户名 这个目录下。
3,配置tomcat:
首先打开
sudo gedit /etc/profile
添加
export CATALINA_HOME="你的tomcat5.5安装目录"
保存即可。
4，开启tomcat:打开终端，先进入你的tomcat5.5安装目录，再运行startup.sh。代码是
cd 你的tomcat5.5安装目录/bin
./startup.sh
如果配置正确，将显示
Using CATALINA_BASE: 你的tomcat5.5安装目录
Using CATALINA_HOME: 你的tomcat5.5安装目录
Using CATALINA_TMPDIR: 你的tomcat5.5安装目录/temp
Using JRE_HOME: /usr/lib/jvm/java-5-sun
如果出现touch:
cannot touch 等错误，找到提示出错的文件夹，更改其权限为读写即可。代码为
sudo chmod 766 需修改的目录 -R
如果还不行，将该文件夹及子文件权限全部开放，在home目录下，怎么更改都不会影响系统。进入需修改的目录