大漠驼铃

置身浩瀚的沙漠,方向最为重要,希望此blog能向大漠驼铃一样,给我方向和指引。
Java,Php,Shell,Python,服务器运维,大数据,SEO, 网站开发、运维,云服务技术支持,IM服务供应商, FreeSwitch搭建,技术支持等. 技术讨论QQ群:428622099
随笔 - 238, 文章 - 3, 评论 - 117, 引用 - 0
数据加载中……

amber9单机版安装

1.安装

(1)把AMBER9.TGZ文件拷贝到/usr/local/

#cp–rf /media/AMBER9/AMBER.TGZ /usr/local/

(2)把AMBER9解压到/usr/local/amber9

#tar–zxvf AMBER9.TGZ

2.bugfix.all补丁  http://amber.scripps.edu下载

(1)bugfix.all拷贝到/usr/local/amber9目录下

#cp–rf bugfix.all /usr/local/amber9

(2)#cd /usr/local/amber9

#patch-p0 -N -r patch-rejects < bugfix.all

3.安装INTEL编译器intel fortran和intel c++

http://www.intel.com/cd/software/products/asmo-na/eng/282048.htm

http://www.intel.com/cd/software ... ers/clin/277618.htm

下载 l_cc_p_10.0.023_ia32.tar.gz 与 l_fc_p_10.0.023_ia32.tar.gz

解压文件并执行

#./install.sh ;按说明一步一步安装,默认安装在/opt/intel

安装libstdc++.so.5

#yum -y install compat-libstdc++-33


4.设置编译器环境

#vi/etc/profile

AMBERHOME=/usr/local/amber9

exportAMBERHOME

source/opt/intel/fc/10.0.023/bin/ifortvars.sh

source/opt/intel/cc/10.0.023/bin/iccvars.sh

保存并重启系统

5.进入AMBERHOME/src

#cd $AMBERHOME/src

#./configureifort_ia32

#makeserial

6.测试基本的AMBER

#cd$AMBERHOME/test

#maketest.serial

posted on 2010-01-06 16:10 草原上的骆驼 阅读(265) 评论(0)  编辑  收藏 所属分类: Computer Chemistry


只有注册用户登录后才能发表评论。


网站导航: