分析了一下commons mail的源码找到了原因。源码如下:
public class SimpleEmail extends Email
{
public Email setMsg(String msg) throws EmailException, MessagingException
{
if (EmailUtils.isEmpty(msg))
{
throw new EmailException("Invalid message supplied");
}

setContent(msg, TEXT_PLAIN);
return this;
}
}

Email代码片段
public void setContent(Object aObject, String aContentType)
{
this.content = aObject;
if (EmailUtils.isEmpty(aContentType))
{
this.contentType = null;
}
else
{
// set the content type
this.contentType = aContentType;

// set the charset if the input was properly formed
String strMarker = "; charset=";
int charsetPos = aContentType.toLowerCase().indexOf(strMarker);
if (charsetPos != -1)
{
// find the next space (after the marker)
charsetPos += strMarker.length();
int intCharsetEnd =
aContentType.toLowerCase().indexOf(" ", charsetPos);

if (intCharsetEnd != -1)
{
this.charset =
aContentType.substring(charsetPos, intCharsetEnd);
}
else
{
this.charset = aContentType.substring(charsetPos);
}
}
}
}

email.send();的send方法将调用
public void buildMimeMessage() throws EmailException
{
try
{
this.getMailSession();
this.message = new MimeMessage(this.session);

if (EmailUtils.isNotEmpty(this.subject))
{
if (EmailUtils.isNotEmpty(this.charset))
{
this.message.setSubject(this.subject, this.charset);
}
else
{
this.message.setSubject(this.subject);
}
}

// ========================================================
// Start of replacement code
if (this.content != null)
{
this.message.setContent(this.content, this.contentType);
}
// end of replacement code
// ========================================================
else if (this.emailBody != null)
{
this.message.setContent(this.emailBody);
}
else
{
this.message.setContent("", Email.TEXT_PLAIN);
}

if (this.fromAddress != null)
{
this.message.setFrom(this.fromAddress);
}
else
{
throw new EmailException("Sender address required");
}

if (this.toList.size() + this.ccList.size() + this.bccList.size() == 0)
{
throw new EmailException(
"At least one receiver address required");
}

if (this.toList.size() > 0)
{
this.message.setRecipients(
Message.RecipientType.TO,
this.toInternetAddressArray(this.toList));
}

if (this.ccList.size() > 0)
{
this.message.setRecipients(
Message.RecipientType.CC,
this.toInternetAddressArray(this.ccList));
}

if (this.bccList.size() > 0)
{
this.message.setRecipients(
Message.RecipientType.BCC,
this.toInternetAddressArray(this.bccList));
}

if (this.replyList.size() > 0)
{
this.message.setReplyTo(
this.toInternetAddressArray(this.replyList));
}

if (this.headers.size() > 0)
{
Iterator iterHeaderKeys = this.headers.keySet().iterator();
while (iterHeaderKeys.hasNext())
{
String name = (String) iterHeaderKeys.next();
String value = (String) headers.get(name);
this.message.addHeader(name, value);
}
}

if (this.message.getSentDate() == null)
{
this.message.setSentDate(getSentDate());
}

if (this.popBeforeSmtp)
{
Store store = session.getStore("pop3");
store.connect(this.popHost, this.popUsername, this.popPassword);
}
}
catch (MessagingException me)
{
throw new EmailException(me);
}
}
由代码可以知道纯文本方式最终调用了Java Mail的
message.setContent(this.content, this.contentType);
content是内容
contentType是类型，如text/plain,
(我们可以试试直接用Java mail发邮件，设置文本内容不使用setText方法，也使用setContent("测试", "text/plain")方式，你可以看到内容也是乱码)
关键就在于text/plain，我们改成text/plain;charset=gb2312，ok乱码解决了。在commons mail我们看SimpleEmail 类中setMsg方法调用的就是 setContent(msg, TEXT_PLAIN);我们只需要将Email类中的常量TEXT_PLAIN修改一下加入 charset=你的字符集 ，重新打包jar，这样就可以了

import java.util.Date;
import java.util.Properties;
import javax.mail.Message;
import javax.mail.MessagingException;
import javax.mail.Session;
import javax.mail.Transport;
import javax.mail.internet.AddressException;
import javax.mail.internet.InternetAddress;
import javax.mail.internet.MimeMessage;

public class TestMail {

public final static String SMTPSERVER = "smtp.163.com";
public final static String POPSERVER = "pop.163.com";
public final static String ACCOUNT = "test";
public final static String PWD = "test";
public final static String MAILADDR = "test@163.com";

public void sendMail(String to, String from, String subject, String body) throws AddressException, MessagingException {
Properties pro = System.getProperties();
pro.put("mail.smtp.host", SMTPSERVER);
pro.put("mail.smtp.auth", "true");
Session session = Session.getDefaultInstance(pro, null);

Message msg = new MimeMessage(session);
msg.setFrom(new InternetAddress(from));
msg.setRecipient(Message.RecipientType.TO, InternetAddress.parse(to, false)[0]);
msg.setSubject(subject);
msg.setText(body);
msg.setHeader("X-Mailer", "LOTONtechEmail");
msg.setSentDate(new Date());

Transport transport = session.getTransport("smtp");
System.out.println("connecting...");
transport.connect(SMTPSERVER, ACCOUNT, PWD);
System.out.println("Sending message");
transport.sendMessage(msg, msg.getAllRecipients());
transport.close();
}

public static void main(String[] args) {
TestMail test = new TestMail();
try {
test.sendMail(MAILADDR, MAILADDR, "test", "我的一个测试");
} catch (AddressException e) {
e.printStackTrace();
} catch (MessagingException e) {
e.printStackTrace();
}
}
}

在eclipse下开发基于axis的WebService其实很简单，但也有不少步骤，以下对每个步骤进行说明

/**
*
* @author honghao
* @axis.service scope = "Request" urn = "TestService"
*/
public class TestService {
/**
* @param name
* @axis.method
*/
public String test(String name){
return "hello " + name;
}
}
其中@axis.service表示TestService作为服务类，@axis.method表示输出test()方法作为WebService

4) 配置xdoclet
打开project->properties，在XDoclet Configurations中添加一个新的配置，可以任意取名，此处为"webservice"，在这个配置中添加ejbdoclet,在其中再添加fileset用于指定对哪些文件执行xdoclet(要指明文件的路径)，和axisdeploy，axisdeploy不用进行任何设置。在ejbdoclet中需要指定destdir生用于指示生成的文件所在的路径。

5) 运行xdoclet.右击项目工程，执行Run Xdoclet菜单，如果配置没有错误的话，应该在目标路径下生成deploy-TestService.xml,这是一个axis用于生成server-config.wsdd文件的部署文件。
这里需要注意的是，如果类文件是放在某个包下的时候，我无法生成deploy-TestService.xml文件，但是将类文件放在根路径下就可以生成了，原因不名.

6) 生成server-config.wsdd部署文件.这个文件其实是由axis的一个工具生成的，但是直接运行这个工具太麻烦，所以我们还需要生成一个ant构建文件，使其能自动生成：
在web项目的根路径下新建build.xml，输入以下文本：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<property name="axis_lib_path" value="${axis.lib}"/>
<property name="wsdl.dir" location="wsdl" />
<path id="axis.lib.path">
<fileset dir="${axis_lib_path}">
<include name="*.jar" />
</fileset>
</path>
<path id="project.classpath">
<pathelement location="wsdl"/>
</path>
<target name="deploy">
<java classname="org.apache.axis.utils.Admin" fork="true" dir="WEB-INF"> <!--dir对应生成文件的位置-->
<classpath refid="axis.lib.path" />
<arg value="server" />
<arg value="${wsdl.dir}/deploy-TestHandler.xml" /> <!--TestHandler对应上面的xml文件名TestService-->
</java>
</target>
</project>
注意：wsdl是刚才生成的deploy-TestService.xml所在的目录,org.apache.axis.utils.Admin是axis提供的工具类，其他路径设置请根据实际项目进行适当调整。
保存后，右击build.xml执行Run->Ant 构建，如果配置正确，则会在WEB-INF目录下生成server-config.wsdd文件
还有ant编译的时候需要axis的lib。

7) 仿造axis提供的sample工程在tomcat中进行部署，在浏览器中输入
http://localhost:8080/axis/services
会列出所有的WebService
输入http://localhost:8080/axis/services/TestService?wsdl
会输出相应的wsdl内容
然后就可以用相应的工具进行测试了。