InputStream keyfis=new FileInputStream(pubfilename);
            byte encKey[] = new byte[keyfis.available()];
            keyfis.read(encKey);
            keyfis.close();
            X509EncodedKeySpec pubKeySpec = new X509EncodedKeySpec(encKey);
            KeyFactory keyFactory = KeyFactory.getInstance("DSA");
            PublicKey pubkey=keyFactory.generatePublic(pubKeySpec);
            DSAPublicKeySpec pubkeyspec=(DSAPublicKeySpec) keyFactory.getKeySpec(pubkey, DSAPublicKeySpec.class);
            System.out.println("P="+pubkeyspec.getP());
            System.out.println("Q="+pubkeyspec.getQ());
            System.out.println("G="+pubkeyspec.getG());
            System.out.println("Y="+pubkeyspec.getY());

P=178011905478542266528237562450159990145232156369120674273274450314442865788737020770612695252123463079567156784778466449970650770920727857050009668388144034129745221171818506047231150039301079959358067395348717066319802262019714966524135060945913707594956514672855690606794135837542707371727429551343320695239
Q=864205495604807476120572616017955259175325408501
G=174068207532402095185811980123523436538604490794561350978495831040599953488455823147851597408940950725307797094915759492368300574252438761037084473467180148876118103083043754985190983472601550494691329488083395492313850000361646482644608492304078721818959999056496097769368017749273708962006689187956744210730
Y=104878378611578608516131988304241730575226860461304117604293580069983220227094632807881557460560834347944389679413307090500106772833435437017122610074687673247552012771759005247409187709312922876281831426019398155097541955193653855246734321859930303643524786168850036251099739995507172205951987756012523624501

import com.atlassian.license.LicensePair;

import java.math.BigInteger;
import java.security.KeyFactory;
import java.security.Signature;
import java.security.interfaces.DSAPrivateKey;
import java.security.spec.DSAPrivateKeySpec;
import java.util.Date;

public class JIRAKeyGen {
    public static void main(String[] args) {
        Date dt = new Date();
        long d = dt.getTime();
        BigInteger x = new BigInteger("240907294874328356661328650403099424255880489796");
        BigInteger p = new BigInteger("178011905478542266528237562450159990145232156369120674273274450314442865788737020770612695252123463079567156784778466449970650770920727857050009668388144034129745221171818506047231150039301079959358067395348717066319802262019714966524135060945913707594956514672855690606794135837542707371727429551343320695239");
        BigInteger q = new BigInteger("864205495604807476120572616017955259175325408501");
        BigInteger g = new BigInteger("174068207532402095185811980123523436538604490794561350978495831040599953488455823147851597408940950725307797094915759492368300574252438761037084473467180148876118103083043754985190983472601550494691329488083395492313850000361646482644608492304078721818959999056496097769368017749273708962006689187956744210730");
        try {
            DSAPrivateKeySpec keyspec = new DSAPrivateKeySpec(x, p, q, g);
            KeyFactory keyFactory = KeyFactory.getInstance("DSA");
            DSAPrivateKey prikey = (DSAPrivateKey) keyFactory.generatePrivate(keyspec);
            String messageString = "267^" + d + "^" + d + "^blogjava";
            //生成签名hash
            Signature signature = Signature.getInstance("SHA1withDSA");
            signature.initSign(prikey);
            signature.update(messageString.getBytes());
            byte[] lichash = signature.sign();
            //编码
            LicensePair pair = new LicensePair(messageString.getBytes(), lichash);
            System.out.println(pair.toString());
        } catch (Exception ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
    }
}

  当然还有另外一种方法，自己生成DSA算法的key，然后覆盖原来的bug.class,利用与上面相同的办法就可以生成license了。
示例代码如下：

public void genDSAKey() {
        try {
            //生成DSA key
            KeyPairGenerator gen = KeyPairGenerator.getInstance("DSA");
            KeyPair kp = gen.genKeyPair();
            DSAPublicKey pubkey = (DSAPublicKey) kp.getPublic();
            DSAPrivateKey prikey = (DSAPrivateKey) kp.getPrivate();
            saveEncodedData(pubkey.getEncoded(), "bug.class");
            saveEncodedData(prikey.getEncoded(), "privatekey.key");
            //签名计算，下次需要直接从文件中读取privatekey.key,初始化prikey
            Signature signature = Signature.getInstance("SHA1withDSA");
            signature.initSign(prikey);
            Date dt=new Date();
            long d = dt.getTime();
            String messageString = "267^" + d + "^" + d + "^blogjava";
            System.out.println(dt.getTime());
            signature.initSign(prikey);
            signature.update(messageString.getBytes());
            byte[] lichash=signature.sign();
            LicensePair pair=new LicensePair(messageString.getBytes(),lichash);
            System.out.println(pair.toString());
        } catch (Exception ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
    }

    public boolean saveEncodedData(byte[] data, String filename) {
        boolean res = true;
        try {
            FileOutputStream fs = new FileOutputStream(filename);
            fs.write(data);
            fs.close();
        } catch (Exception ex) {
            res = false;
            ex.printStackTrace();
        }
        return res;
    }

注意上面的代码需要调用atlassian-extras-0.7.10,在WEB-INF\lib目录下面可以找到